药师殿是灵隐寺的第三重大殿，供奉的是“东方三圣”：药师佛像及日光天子、月光天子。殿中莲台座上结跏趺坐的是药师佛，是东方净琉璃世界的教主，左边站立日光菩萨，右边站立月光菩萨。